结古寺藏语称“结古顿珠椤”，意为“结古义成洲”。结古寺以建筑宏伟、寺僧众多、文物丰富、多名僧高徒在我国藏区闻名遐迩。整个寺院依山势而建，殿堂僧舍错落有致，远望似多层楼阁耸立，主体建筑“都文桑舟嘉措”经堂系由萨边寺大堪布巴德秋君和嘉那活佛第一世多项松却帕文设计，在德格佐钦寺支持下，扎武迈根活佛主持修建，可容纳1000扎哇诵经。此外，讲经院、大昭殿、弥勒殿、嘉那和文保活佛院等都规模较大，且各具特色。

经堂和殿堂内主供释迦牟尼佛、莲花生大士、吉祥天女、宝帐怙主、旃檀木雕度母和西藏萨迦五祖等各类铜制馏金和优质木雕佛像3400多尊。珍藏有《甘珠尔》和《丹珠尔》等各种经典近万卷。另有八思巴所赠释迦牟尼唐卡、旃檀度母像及传为扎武百户祖传宝刀等许多珍贵文物。

但最初，结古寺原是苯教的寺院，后来改宗噶举派。蒙元时期，忽必烈的国师八思巴途径结古地区，开始于是逐步将当地寺庙改宗。到了明代，结古寺终于变为萨迦派寺院。

结古寺历史上出过许多高僧，最出名的大概要数一世的嘉那活佛了。这位活佛年轻时曾在印度、锡金、西藏、以及汉地的峨眉山、五台山、打箭炉等处游历修行，精通汉文等多种语言。并为新寨玛尼城成为“世间第一大玛尼堆”奠定了基础。嘉那还多才多艺，创始了被称为“多顶求卓”的100多种舞蹈，玉树地区成为著名的藏族歌舞之乡即源于此。另外，九世班禅大师却吉尼玛1937年在返藏途中圆寂于本寺。