药王山石刻是药王山景区最大的亮点所在。这些石刻数量众多、内容丰富多彩，除大量的摩岩造像、摩岩石刻石牌坊，动物、植物石刻等文物外，还包括北魏到隋唐造像碑和历代记事碑三百余通，被称为碑林。

药王山是中国保存北朝、隋、唐造像碑最多的地方，主要有碑刻和石窟两种。其中碑刻100余通，以明朝隆庆年间雕刻的《千金要方》、《海上仙方》等6碑最为珍贵。这些医药治疗方法和卫生知识，是孙思邈总结了中国古代医药知识和自己一生实践经验而汇集的精华，是研究中国医药学的宝贵资料。另还有全国字数最多的石鼓文刻石、罕见的孔子十字碑、镇宅辟邪作用的龟蛇”碑、保存完好的宋徽宗瘦金全碑石等。

石刻造像石包括清末以来出土的北魏至唐代各类造像100余通，又以北魏始光元年的《魏文朗造像碑》、太和二十年的《姚伯多兄弟造像碑》、正光五年的《仇臣生造像碑》、北周武成元年的《绛阿鲁造像碑》、隋开皇十五年的《张和仁造像碑》等最为出名。

石窟分布于山之东南隅东西长20多米的崖面上，基本为隋唐时期凿刻。现存7个洞窟、23个佛龛，共有佛像40多尊。龛内浮雕佛、菩萨，龛边浅雕天王、供养人。其中以2号窟的北周弥勒像最为精美。